巨屌 自慰 人命与海洋科学学院王江新、赵丽青团队告捷领路染色体水平的纤细裸藻基因组图谱

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    巨屌 自慰 人命与海洋科学学院王江新、赵丽青团队告捷领路染色体水平的纤细裸藻基因组图谱
    发布日期:2024-10-07 14:02    点击次数:94

    巨屌 自慰 人命与海洋科学学院王江新、赵丽青团队告捷领路染色体水平的纤细裸藻基因组图谱

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    纤细裸藻(Euglena gracilis)是一种单细胞微生物巨屌 自慰,属于原生生物界裸藻门。看成间核生物的典型代表,纤细裸藻不仅在形态上兼具动植物细胞的特征,还大概通过光息争用自养或通过浸透养分异养。它私有的叶绿体结构为盘问光合生物的内共生发源和叶绿体演化提供了矜重的印迹。

    深圳大学人命与海洋科学学院王江新诠释团队自2015年开动对裸藻基因组进行领路。历程近十年的奋勉巨屌 自慰,团队近日告捷构建了纤细裸藻的染色体级别基因组图谱。比较2019年剑桥大学团队的盘问遵守,基因组拼装纠合性遵守普及了1000倍。这使纤细裸藻成为裸藻纲中首个领有染色体级别基因组的物种,对裸藻基因组学和合成生物学等谈论范畴的盘问具有要紧道理。

    2024年7月16日,深圳大学人命与海洋科学学院王江新诠释与化学与环境工程学院赵丽青诠释团队在Nature出书集团旗下期刊ScientificData(五年平均影响因子:8.9)发表题为“A chromosome-level genome assembly for the paramylon-producing microalgaEuglena gracilis”的盘问论文。盘问团队诓骗二代Illumina、三代PacBio、Bionano以及Hi-C测序时间,拼装赢得高质地的染色体级基因组图谱。该基因组大小约2.37Gb,包含46条染色体,contigN50为619Kb,scaffoldN50为1.12Mb,并谨防到了39362个卵白编码基因。

    纤细裸藻染色体级基因组图谱,展示了其多眉目基因组特征:外圈数字代表46条染色体编号。图谱分为四层:基因密度(绿色)、转座子密度(蓝色)、串联叠加序列密度(红色),反馈各样元件在基因组中散播的举座情况;GC含量百分比(棕色),反馈不同染色体区域碱基构成。中心为纤细裸藻的显微镜图像。

    深圳大学人命与海洋科学学院诠释王江新和化学与环境工程学院诠释赵丽青为论文的共同通信作家,深圳大学人命与海洋科学学院副盘问员陈子熙、云南农业大学诠释董扬与博士生段胜常为论文的共同第一作家,深圳大学人命与海洋科学学院为该论文的第一完成单元。深圳大学人命与海洋科学学院助理诠释卞超、盘问员王筠、诠释黎双飞、副诠释谢宁、诠释徐颖、诠释石琼、诠释胡章立、诠释雷安对等参与了本形态盘问责任。

    该盘问赢得了国度重心研发计较形态(2021YFA0910800,2018YFA0902500巨屌 自慰,2020YFA0908703)、国度当然科学基金形态(41876188)、深圳市科创委(KCXFZ202002011006448)、深圳市科技计较(KCXST20221021111206015,KCXFZ20201221173404012)和广东省当然科学基金(2024B1515020034)等形态资助。